Phylogene Laboratoire d'Analyses Spécialisées Spectrometrie de masse - Retour vers l'Accueil

Prestations

Exemple de prestation

- Identification et abondance relative de composés (label-free nanoLC-MS/MS) pour la caractérisation des ingrédients
Technique non-ciblée pour l’identification et la quantification des 50 protéines les plus représentées dans un proteome.

- Identification et quantification relative des protéines d’échantillons (label-free nanoLC-MS/MS) pour la recherche de biomarqueurs, le biodiscovery, la découverte des effets.
Technique non-ciblée et exhaustive à hauteur de 2/3 à 3/4 du protéome de la cellule.

- Analyse dédiée de bioinformatique/biostatistique (CORAVALIDTM)
Technique qui permet d’exploiter avantageusement toute l’information pour une bonne comprehension des phénomènes.
http://ms.phylogene.com/Local/msphylogene/files/33/NEWS.6.Neurological.diseases.proteomics.pdf
http://ms.phylogene.com/Local/msphylogene/files/82/Effect.study.example.112016.pdf
http://ms.phylogene.com/Local/msphylogene/files/91/Voegeli_et_al-2017-International_Journal_of_Cosmetic_Science.pdf
http://ms.phylogene.com/Local/msphylogene/files/83/NEWS.29B.FFPE.proteomics.to.enhance.diagnostic.biomarker.and.therapeutic.target.discovery..pdf
http://ms.phylogene.com/Local/msphylogene/files/53/NEWS.22.Serum.proteomics.biomarker.in.eye-s.diseases..pdf

- Analyse dédiée de bioinformatique/biostatistique complémentaire du microbiome (MicroXploreTM)
Technique qui, en complément de CORAVALIDTM pour l’hôte, permet d’exploiter les données du protéome microbien au niveau fonctionnel, dans l’étude des effets sur le microbiote.
http://ms.phylogene.com/Local/msphylogene/files/94/NEWS.39.Functional.studies.for.human.and.microbiome.interactions.pdf
http://ms.phylogene.com/Local/msphylogene/files/93/NEWS.41.Proteomic.and.metaproteomic.approaches.to.understand.host-microbe.interactions.pdf
http://ms.phylogene.com/Local/msphylogene/files/88/Microbiome.Active.ingredient.study.012016..pdf
- Mise au point et dosage multiplex ciblé (Multiple Reaction Monitoring)
Technique qui est indépendante des anticorps et qui permet de doser en une étape plusieurs 10aines de protéines
http://ms.phylogene.com/Local/msphylogene/files/49/NEWS.17.Multiplex.SRM.method.or.ELISA.pdf

-Phosphoprotéomique
Phosphoprotéines  à Serine/threonine mono- et polyphosphorylées
Modifications post traductionnelles après enrichissement en phosphoprotéines

http://ms.phylogene.com/Local/msphylogene/files/52/NEWS.19.Phosphoproteomics.to.characterize.cells.or.biopsies.in.cancer.pdf

- Modifications post traductionnelles
Identification des isoformes (acétylation, oxydation,méthylation, ubiquitination…) et comparaison par quantification relative avec la nanoLC-MS/MS

-Métabolomique
Principalement par la protéomique. Quantification relative label-free ou quantification ciblée d’échantillons

-Kinome profiling
En mode non ciblé, quelle kinase est sous ou sur-exprimée dans le tissu
-Kinome inhibition profiling
Comparaison de conditions avec et sans inhibiteur en mode non ciblé.

-Drug inhibition measurement
IC50 de toutes les kinases identifiables en mode non ciblé
http://ms.phylogene.com/Local/msphylogene/files/38/NEWS.12.Cancer-.kinome.and.kinase.inhibitors.studies.pdf

 

Tarifs

Référence

Prestations

Prix unitaire ¤HT

Détail des prestations

00912-01

Identification de protéines : Shotgun proteomics

1 à 5 échantillons

220(1)

Digestion, dessalage par SPE, analyse LC-MS/MS, interrogation de banques de données

00912-02

Identification des protéines : Shotgun proteomics

 (6 échantillons et plus)

190(1)

Digestion, dessalage par SPE, analyse LC-MS/MS, interrogation de banques de données

00912-03

Caractérisation de la masse exacte de protéines entières(2)

280

Dessalage en ligne, analyse LC-MS  déconvolution des spectres et détermination de la masse exacte, analyses des micro hétérogénéités

00912-04

Quantification par méthode MRM

Nous contacter

Digestion, dessalage par SPE, analyse LC-MS/MS, quantification contre une gamme de standards marqués isotopiquement

00912-05

Développement de méthodes MRM

Nous contacter

 Détermination des cibles par approche in vitro et in silico, détermination des transitions et des paramètres physico-chimiques optimums, détermination des limites de détection et de quantification

00912-06

Analyse différentielle, quantification relative  par technique Label free

Nous contacter

Digestion, dessalage par SPE, analyse LC-MS/MS, traitement statistique des données

00912-07

Analyse différentielle, quantification relative  par technique iTRAQ®

Nous contacter

Digestion, marquage iTRAQ, dessalage, analyse LC-MS/MS, quantification relative.

00912-08

Identification de protéines par 2D-LC-MS/MS en ligne

Nous contacter

Digestion, dessalage par SPE,  analyse 2D-LC-MS/MS, interrogation de banques de données

00912-09

Quantification par technique SWATH-MS

Nous contacter

Digestion, dessalage des échantillons, analyse SWATH-MS, quantification des composés

 

  1. Prix applicable à l’analyse d’extraits protéiques, nous contacter pour tout autre type d’échantillon
  2. Prestation applicable à l’analyse de protéines purifiées uniquement.

 

Toute prestation sera formalisée par l’envoi d’un devis qui précisera:

  • la nature de l’analyse,
  • les modalités de transmission des résultats,
  • les délais d'analyse,
  • le prix,
  • la quantité d'échantillons à envoyer,
  • les modalités de prélèvement,
  • l'information à donner à l'arrivée de l'échantillon.

A l’arrivée des échantillons, vous serez prévenu de toute non-conformité à la commande

 

Un contrat peut être établi selon vos souhaits.

 

Qualité

 

Phylogene est un laboratoire accrédité ISO 17025 par le COFRAC (n° 1-2128).

Phylogene est membre des commissions de normalisation V03E et V03B de l’AFNOR ainsi que du groupe CEN WG12 sur les allergènes

 

Compétitivité

 

Notre souci est de vous apporter les délais les plus courts et de vous proposer les meilleurs tarifs. Les tarifs sont adaptés au nombre d’échantillons.